Hlien zachytáva patogény, mukociliárny eskalátor odstraňuje patogény skôr, ako sa dostanú do pľúc, a aj keď sa dostanú do pľúc, v alveolách, pohrudnici a cievnom riečisku sú prítomné fagocytujúce pľúcne makrofágy, ktoré sa postarajú o patogény, ktoré uniknú prvým dvom bariéram. Samozrejme, aj makrofágy môžu zlyhať, a tak vzniká pľúcna infekcia.
Mechanizmus je v podstate rovnaký. Ľudské telo nie je samo o sebe „inteligentné“. Nemôže ničomu zabrániť, reaguje na to, čo sa deje. (V prípade alergií reaguje nadmerne)
To, čo nos neprefiltruje, ide do pľúc. Ak je látka príliš veľká na to, aby sa vstrebala, vylúči sa ako čokoľvek iné, rovnako ako prach. Za určitých okolností tam jednoducho zostane a spôsobí problém (pozri silikóza).
Ak ide o chemickú zlúčeninu, ktorú môže telo absorbovať, absorbuje ju. Potom sa spracuje a vylúči močom. (Za predpokladu, že nebola aktívne infekčná).
